碧溪村1949年屬呂九鄉(xiāng)，1951改屬碧溪鄉(xiāng)，1956年后歸呂溪鄉(xiāng)，1957年與碧坑合并并為碧溪高級社，公社化時稱碧溪大隊，1961年劃出碧坑，1984年稱碧溪村，1992年并入東溪鄉(xiāng)；朱嶺村1949年稱呂九鄉(xiāng)朱格村，1956年歸呂溪鄉(xiāng)，為朱嶺高級社，公社化時稱朱嶺大隊，1984年稱朱嶺村，1992年并入東溪鄉(xiāng)；雙林村1949年屬坪巖鄉(xiāng)，后歸金星鄉(xiāng)，1961年歸呂溪鄉(xiāng)，后歷稱朱林大隊、林坑大隊、雙林大隊，1984年稱雙林村，1992年并入東溪鄉(xiāng)；仟巖村1949年是呂九鄉(xiāng)仟坑、巖頭背村，1956年歸呂溪鄉(xiāng)，為仟巖高級社，公社化時稱仟巖大隊1984年稱仟巖村，1992年并入東溪鄉(xiāng)；2004年，碧溪與朱嶺、雙林，仟巖4個合并為碧溪村。
2011年隨東溪鄉(xiāng)并入玉壺鎮(zhèn)。
2019年4月17日碧坑村、碧溪村合并建立碧溪村。