明嘉靖年間屬南社鄉(xiāng)十三都、十五都；1931年建有飛云、南社、中寶、卓峰等鄉(xiāng)，屬第二區(qū)；1938年飛云鄉(xiāng)與南社鄉(xiāng)合并為云南鄉(xiāng)；1946年與寶峰鄉(xiāng)（系中寶、卓峰鄉(xiāng)合并而成）合并，稱云峰鄉(xiāng)，屬仙降區(qū)；1949年8月置吳橋、孫橋鄉(xiāng)，屬仙降區(qū)；1958年9月改稱吳橋、孫橋生產(chǎn)大隊（1959年3月改為吳橋、孫橋管理區(qū)），屬海濱（仙降）公社；1961年9月改建吳橋、孫橋人民公社，屬仙降區(qū)；1984年復(fù)置吳橋、孫橋鄉(xiāng)，1985年12月撤吳橋鄉(xiāng)置飛云鎮(zhèn)，仍屬仙降區(qū)；1992年5月撤區(qū)后與孫橋鄉(xiāng)合置飛云鎮(zhèn)；2000年6月與林垟鎮(zhèn)、閣巷鎮(zhèn)、云周鄉(xiāng)合置飛云鎮(zhèn)；2011年4月撤飛云鎮(zhèn)，分置飛云、南濱2個街道；2015年12月從飛云街道析置云周街道。