南宋咸淳間(1265~1274)屬於潛縣豐國鄉(xiāng),清嘉慶十七年(1812)南山、宛村、蘭塢莊(董村)屬豐國后鄉(xiāng)。
民國初屬於潛城,民國21年(1932)蘭塢、宛村屬豐溪鄉(xiāng),民國36年(1947)屬潛陽鎮(zhèn)至解放。
1950年為橫山鄉(xiāng)南山村,1958年為昌化縣潛陽公社潛陽管理區(qū)南山生產(chǎn)隊(duì),1960年9月屬臨安縣,1961年為潛陽公社南山、燕村、董村生產(chǎn)大隊(duì),1984年為於潛鎮(zhèn)南山、燕村、董村村。
2007年村規(guī)模調(diào)整,三村合并為南山村,轄9個(gè)自然村。