解放初期為信智鄉(xiāng)湖井村。
1956年合作化時(shí)，屬信智鄉(xiāng)共豐高級(jí)社。
1958年公社化時(shí)，定名湖井大隊(duì)，屬信智管理區(qū)。
1961年隸屬信智公社。
1984年改稱信智鄉(xiāng)湖井村民委員會(huì)。
1992年5月撤鄉(xiāng)為赤溪鎮(zhèn)湖井村民委員會(huì)。
2001年行政村撤擴(kuò)并將青山村并入，稱湖井村民委員會(huì)2011年行政區(qū)劃調(diào)整仍屬赤溪鎮(zhèn)。
1986年11月經(jīng)縣政府批準(zhǔn)為第二次國(guó)內(nèi)革命戰(zhàn)爭(zhēng)時(shí)期老區(qū)村。
2019年蒼南縣村規(guī)模調(diào)整，湖井村、后垵村、烏巖村合并成湖井村。