晉寧縣原系晉寧、昆陽(yáng)兩縣合并組建。
夏商時(shí)屬梁州，戰(zhàn)國(guó)時(shí)，莊蹻入滇后在此建立滇國(guó)。
西漢元封二年（前109）設(shè)滇池縣，為滇王都邑及益州郡治所，同時(shí)置建伶縣（今昆陽(yáng)）。
三國(guó)蜀漢滇池縣屬建寧郡。
東晉初年元帝時(shí)（317～322），改益州郡為晉寧郡，取晉代安寧之意，為使用“晉寧”之始，屬寧州，滇池縣為寧州治。
唐武德四年（621）置晉寧縣，屬昆州。
唐武德七年（624）以原建伶縣地置望水縣，治今大古城，屬鉤州。
南詔時(shí)升晉寧縣為晉寧州，屬拓東節(jié)度。
大理時(shí)為陽(yáng)城堡部和巨橋部，均屬善闡府。
元憲宗七年立陽(yáng)城堡萬(wàn)戶(hù)府和巨橋萬(wàn)戶(hù)府，旋改為晉寧州及昆陽(yáng)州，屬中慶路。
明屬云南府，清沿用。
1913年改為晉寧縣和昆陽(yáng)縣，均屬滇中道。
1916年廢道，直屬省。
1950年屬玉溪專(zhuān)區(qū)。
1958年昆陽(yáng)縣并入晉寧縣，治移昆陽(yáng)鎮(zhèn)。
1959年呈貢縣并入。
1960年改屬昆明市。
1963年原呈貢縣析出置呈貢區(qū)。
2016年11月24日經(jīng)國(guó)務(wù)院批準(zhǔn)晉寧縣撤縣設(shè)區(qū)，沿用至今。