7世紀(jì)前，聶榮地方屬外象雄轄區(qū)。
后被蘇毗雅松占據(jù)，成為蘇毗部落聯(lián)盟成員。
8世紀(jì)中葉，蘇毗與吐蕃統(tǒng)一，聶榮一帶劃入“蘇毗茹”。
9世紀(jì)中葉，吐蕃陷入分裂割據(jù)，聶榮屬于“羌日六部”的“雄索部落”。
南宋寶慶三年（1227），青海蒙古汗的驕兵進(jìn)入藏北，蒙古汗霍爾金格對(duì)藏北地區(qū)開始實(shí)施軍事統(tǒng)治，聶榮北為“霍爾三十九部族”的一部分。
元朝，聶榮縣境內(nèi)只有阿扎買馬（阿美）、阿扎多馬（又稱阿斗）和扎瑪3個(gè)部落。
明末屬蒙古王東宮武藏統(tǒng)治，后為蒙古的和碩特部落管轄。
清康熙五十九年（1720），康熙帝派清軍驅(qū)逐準(zhǔn)噶爾軍隊(duì)后，把聶榮等三十九族地方劃歸西藏地方政府管轄。
1916年，西藏政府開始管轄三十九族地區(qū)，設(shè)立霍而基巧（專署級(jí)）管理各部落。
1941年（藏歷木馬年），西藏地方政府撤銷霍爾基巧，將三十九族地區(qū)劃分為巴青、比如、阿扎白索、色扎、尺牘、丁青6個(gè)宗。
阿扎白索宗駐曲那格。
后因宗址偏僻，逐移到宗中心的色貢，稱為聶榮宗。
宗本由藏政府直接委派。
1950年10月，昌都解放后，三十九族地區(qū)也隨之解散，聶榮宗即歸昌都地區(qū)人民解放委員會(huì)管轄。
1951年7月，中共西藏工委三十九族分工委成立；11月初，即向各宗派出軍事代表，建立軍事代表處。
1956年10月，隨著形勢(shì)的發(fā)展，撤銷軍事代表處，建立聶榮宗黨委，歸昌都分工委丁青中心縣委領(lǐng)導(dǎo)。
1957年，由于昌都地方上層的叛亂分子加劇，根據(jù)中央決定，撤銷聶榮宗黨委。
1959年初，宗解委會(huì)結(jié)束工作。
1959年3月，西藏地方政府和上層反動(dòng)集團(tuán)發(fā)動(dòng)全區(qū)性武裝叛亂，人民解放軍在西藏各界人民的支持下，經(jīng)過一年多的斗爭，平息了這場反革命武裝叛亂，隨之，開展了轟轟烈烈的民主改革運(yùn)動(dòng)。
1959年5月，根據(jù)西藏工委關(guān)于《西藏地區(qū)行政區(qū)劃調(diào)整意見》，聶榮宗改為聶榮縣，劃歸那曲（黑河）專區(qū)。
1960年元月，國務(wù)院正式批準(zhǔn)，同意撤銷聶榮宗，設(shè)置聶榮縣，隸屬黑河專區(qū)。
1970年，改屬那曲地區(qū)。
2017年7月，國務(wù)院下達(dá)《關(guān)于同意西藏自治區(qū)撤銷那曲地區(qū)設(shè)立地級(jí)那曲市的批復(fù)》（國函〔2017〕109號(hào)），同意撤銷那曲地區(qū)，設(shè)立地級(jí)那曲市。
聶榮縣屬那曲市管轄。