民國時期，屬靈鷲鄉(xiāng)第五保。
1951年，建政為帶河鄉(xiāng)所轄。
1955年，建社為靈鷲鄉(xiāng)光輝二、三、四社。
1958年，為靈鷲公社光輝大隊。
1962年，為會龍公社五大隊。
1967年，為民主公社五大隊。
1972年，為會龍公社五大隊。
1981年，地名普查時命名為陡坑公社墩子大隊。
1984年，社改鄉(xiāng)時為陡坑鄉(xiāng)墩子村。
1992年，撤區(qū)并鄉(xiāng)建鎮(zhèn)并入靈鷲鎮(zhèn)，墩子村不變。
1994年9月，恢復陡坑鄉(xiāng)建制，墩子村不變。
2006年6月陡坑鄉(xiāng)又并入靈鷲鎮(zhèn)，仍為墩子村。
2020年，村級建制調(diào)整，撤銷金雞村和墩子村，合并設立墩子村（營府函〔2020〕72號）。