五通橋區(qū)在公元前316年以前屬蜀國轄地。
秦滅蜀，區(qū)境隸蜀郡南安縣。
漢武帝建元六年(前135)，隸犍為郡南安縣。
此后，被兩縣或三縣分治長達(dá)680多年，到元至大四年（1311），才盡隸四川行中書省嘉定府路犍為縣。
1913年，隸上川南道犍為縣。
1935年，為犍為縣第四區(qū)。
1936年，調(diào)整為犍為縣第四區(qū)（五通片）、第五區(qū)（西壩片）。
1949年12月，成立五通橋軍管分會(huì)，隸中國人民解放軍樂山軍事管制委員會(huì)，并受犍為縣領(lǐng)導(dǎo)。
1950年8月，五通片為犍為縣第八區(qū)，西壩片為第九區(qū)。
1951年8月，建立五通橋工作委員會(huì)，10月以犍為縣第八區(qū)建制成立五通橋市(縣級(jí))，市人民政府駐五通鎮(zhèn)生產(chǎn)街(今佑君社區(qū))，轄4鎮(zhèn)24鄉(xiāng)，隸川南行政區(qū)樂山專區(qū)。
1952年8月，犍為縣第九區(qū)（西壩片）所屬的12個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)劃歸五通橋市管轄，為五通橋市第六區(qū)。
調(diào)整后的五通橋市轄6區(qū)、5鎮(zhèn)、35鄉(xiāng)。
1954年6月，樂山縣新廟鄉(xiāng)、杉樹鄉(xiāng)、新云鄉(xiāng)劃歸五通橋市第三區(qū)(牛華片)。
原一、二區(qū)合并為一區(qū)，第五區(qū)改為第二區(qū)，第三區(qū)、第四區(qū)仍置，第六區(qū)劃歸樂山縣。
調(diào)整后，五通橋市轄4區(qū)、4鎮(zhèn)、25鄉(xiāng)。
1958年10月，五通橋市轄2鎮(zhèn)、5公社、1果蔬菜農(nóng)場。
1959年3月，撤銷五通橋市，為樂山縣五通橋區(qū)。
1962年7月，恢復(fù)五通橋市建制，直隸樂山專區(qū)。
1964年5月，改五通橋市為五通橋區(qū)，隸樂山專區(qū)。
1978年5月，五通橋區(qū)與樂山縣合并，成立樂山市（縣級(jí)），五通橋區(qū)為樂山地區(qū)樂山市轄區(qū)。
1985年2月，撤銷樂山地區(qū)，樂山市升為地級(jí)市；由原五通橋區(qū)、西壩區(qū)、安谷區(qū)蔡金鄉(xiāng)、茅橋區(qū)新云鄉(xiāng)組建樂山市五通橋區(qū)(縣級(jí))。