因境內(nèi)有著名的馬祖寺而其名，位于馬祖鎮(zhèn)東北部，面積286.02公頃，耕地164.2公頃，家庭戶859戶，常住人口2240人，下轄15個村民小組。村民委員會設(shè)于7組境內(nèi)，馬祖寺后側(cè)。
馬祖村是我國佛教禪宗第八代祖師馬道一的故鄉(xiāng)。馬祖寺最早建于明萬歷年間，清乾隆十四年重建。2005年8月17日，“馬祖文化節(jié)”在馬祖村隆重開幕，同一天，該鎮(zhèn)也正式更名為馬祖鎮(zhèn)。從2006年開始，按照市委、市政府規(guī)劃要求，馬祖故里建設(shè)將以馬祖村為重點全面啟動。
馬祖村農(nóng)業(yè)結(jié)構(gòu)調(diào)整成效顯著，是該鎮(zhèn)“黨員先鋒工程食用菌示范基地”，是遠(yuǎn)近聞名的食用菌種植之鄉(xiāng)，群眾生活富裕。馬祖村還專門成立了一支文藝表演隊伍，極大的豐富了廣大群眾的精神文化生活。