童寺鎮(zhèn)駐地位于富順縣城東南部，距縣城27公里。
清朝初年，因廟宇龍鳳庵由一童姓改建，為紀(jì)念他，取名童家寺。
清乾隆二十二年（1757）為富順縣東城鄉(xiāng)下東路童家寺保。
中華民國元年（1912）置童寺團(tuán)，民國二十三年（1934）改團(tuán)為鄉(xiāng)。
次年全縣設(shè)6個(gè)區(qū)署屬第2區(qū)，1950年，分為童寺、鄧灣、老寨、德馨4鄉(xiāng)。
民國三十一年（1942）改屬第3指導(dǎo)區(qū)；1950年，經(jīng)過對舊政權(quán)的改造，行政區(qū)劃作重大調(diào)整，全縣劃為16區(qū)，童寺鄉(xiāng)屬15區(qū)。
1955年，析童寺、清平、鄧灣、德馨4鄉(xiāng)置宗元鄉(xiāng)。
1955年11月，縣、區(qū)、鄉(xiāng)（鎮(zhèn)）調(diào)整，設(shè)童寺區(qū)，所轄童寺鄉(xiāng)。
1958年10月，區(qū)劃重大調(diào)整，撤銷童寺區(qū)，設(shè)童寺人民公社歸代寺區(qū)管轄。
1961年恢復(fù)童寺區(qū)建制，所轄童寺人民公社，1983年，童寺公社改為童寺鄉(xiāng)。
1988年撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)。
2001年，撤童寺區(qū)建制，芝溪鄉(xiāng)并入童寺鎮(zhèn)。
2019年8月，撤銷寶慶鄉(xiāng)，將其所屬行政區(qū)域劃歸童寺鎮(zhèn)管轄。