宋、元、明、清屬桂花鄉(xiāng)；清末屬南路總保、東岳鄉(xiāng)；民國二十四年（1935年）后，短時期為青龍鄉(xiāng)；1935年4月紅四方面軍分別在該鄉(xiāng)松林村（五組）罩子壩、青山觀建立了鄉(xiāng)蘇維埃，同年5月屬東青鄉(xiāng)（聯(lián)保）；解放后，1950年建立了禪林鄉(xiāng)農協(xié)會；1951年為東風村，屬禪林鄉(xiāng)；1958年政社合一，改為東風大隊，屬禪林人民公社；1981年地名普查重名改為鈴旗大隊；1984年4月政社合一，復名鈴旗村村民委員會，屬禪林鄉(xiāng)；1992年撤鄉(xiāng)并入東青鎮(zhèn)，屬東青鎮(zhèn)；1994年恢復禪林鄉(xiāng)建制，屬禪林鄉(xiāng)；2004年“強村并組”松林村二組、鈴旗村、臥云村二、五組合并為鈴旗村村民委員會；2006年村（居）委會區(qū)域調整，撤銷鈴旗村、臥云村，恢復原鈴旗村、臥云村、松林村建制。
2020年鄉(xiāng)鎮(zhèn)村級建制調整同意保留鈴旗村村民委員會。