古稱“巴公原”。
相傳為春秋巴子城。
隋唐時，巴公地區(qū)先屬建州丹川縣，后屬晉城澤州縣，一直延續(xù)至清。
直到清雍正6年（1728），澤州升州為府，府置郡鳳臺縣，巴公地區(qū)屬鳳臺縣。
1914年廢澤州府，改鳳臺縣為晉城縣，巴公地屬晉城縣所領(lǐng)。
抗戰(zhàn)前為晉城縣五區(qū)區(qū)公所駐地。
1945年解放后，為晉城縣二區(qū)區(qū)公所駐地。
1953年，劃為巴公、來村、渠頭、東四義、北郜、北堆6個鄉(xiāng)。
1956年，并為巴公、北郜2個鄉(xiāng)。
1958年，建立巴公紅旗人民公社。
1962年，劃出大陽、陳溝部分，改稱巴公人民公社。
1984年改為巴公鎮(zhèn)。
1985年歸屬晉城市郊區(qū)（今澤州縣）。
2001年撤并鄉(xiāng)鎮(zhèn)時，原陳溝鄉(xiāng)并入巴公鎮(zhèn)至今。