1958年8月，中共中央作出《關于在農村建立人民公社問題的決議》，我國全面開展人民公社化運動，實行政社合一、撤鄉(xiāng)建社，農業(yè)生產合作社改稱生產大隊；實行生產資料分別歸公社、生產大隊、生產隊三級組織所有的體制；同年9月，建立南莊生產大隊。
1983年10月，中共中央、國務院聯(lián)合發(fā)出《關于實行政社分開建立鄉(xiāng)政府的通知》，要求實行政社分開，恢復鄉(xiāng)，建立鄉(xiāng)人民政府；同時，生產大隊更名為村，撤銷生產大隊管理委員會，選舉產生村民委員會。
1984年成立南莊村民委員會，隸屬巨城鄉(xiāng)管轄，1984年12月后，屬巨城鎮(zhèn)。
2019年12月28日，根據平政發(fā)〔2019〕16號，衛(wèi)垴村和南莊村合并，合并后村名為“南莊村”。