清代屬榆林縣鎮(zhèn)城和保寧堡口外地域。
1949年6月前，屬河西鄉(xiāng)。
1949年6月后，隸屬榆林縣河西區(qū)，曾設可可蓋、補兔寨鄉(xiāng)。
1950年，設馬合區(qū)、八區(qū)、十一區(qū)。
1958年9月，撤區(qū)改設馬合公社。
1960年1月，并入馬合農場。
1969年1月，復設馬合公社。
1984年7月，改設為鄉(xiāng)。
同年9月，劃出可可蓋、昌汗峁、腦冒海則等7個行政村，設可可蓋鄉(xiāng)。
1997年11月，改設馬合鎮(zhèn)。
2002年5月，可可蓋鄉(xiāng)腦冒海則村并入。