1958年公社化時(shí),屬燈塔公社的一部分;1959年合縣并社時(shí)屬陽郭公社三官廟管區(qū),管區(qū)因駐三官廟而命名;1962年行政區(qū)劃調(diào)整時(shí),在原管區(qū)的基礎(chǔ)上被命名為三官廟公社;1960年文革中被改為紅嶺公社;1970年恢復(fù)三官廟公社之名。
1984年撤銷公社、大隊(duì)、生產(chǎn)隊(duì)、實(shí)行鄉(xiāng)、村建制,隸屬于三官廟鄉(xiāng),2001將三官廟鄉(xiāng)并入大王鄉(xiāng),2011年將大王鄉(xiāng)并入陽郭鎮(zhèn),2016年三官廟村和姚灣村合并為三官廟村。
現(xiàn)隸屬于陽郭鎮(zhèn),沿用至今。