清朝初年，棗園堡隸屬于河合里，道光七年（1827年），棗園堡歸宜祿南鄉(xiāng)大村管轄，村名為棗園堡。
民國改元后，歸宜祿里十甲管轄，村名為棗園村。
民國后期又歸宜祿鄉(xiāng)公所和朱成鄉(xiāng)公所管轄。
解放初，歸宜祿區(qū)田惠鄉(xiāng)管轄，1956年，撤區(qū)并鄉(xiāng)，歸棗園鄉(xiāng)管轄，棗園村成為棗園地區(qū)的政治、經(jīng)濟、文化活動中心。
1958年，棗園村歸縣長武人民公社棗園生產(chǎn)管理區(qū)管轄，1961年，恢復(fù)長武縣置后，歸棗園人民公社管轄，改名為棗園生產(chǎn)大隊。
1984年，政社分設(shè)，成立棗園村村民委員會，歸棗園鄉(xiāng)人民政府管轄。
2011年底，撤鄉(xiāng)并鎮(zhèn)，歸棗園鎮(zhèn)人民政府管轄至今。