雙堠鎮(zhèn)境大部分原為沂水所轄.1939年解放時，稱菜峪鄉(xiāng)。
1941年，將菜峪鄉(xiāng)分為崖子、盆泉兩個區(qū)，盆泉區(qū)歸費東縣，崖子區(qū)歸沂南縣。
1945年，費東縣撤銷建制，盆泉區(qū)劃歸沂南縣。
1956年2月，縣界調整將垛莊區(qū)和崖子區(qū)東河、營后、泉橋、梭莊四個鄉(xiāng)劃給蒙陰縣，同時在原崖子區(qū)的基礎上又從青駝區(qū)劃入部分村莊成立了雙堠區(qū)。
1958年秋，成立雙堠公社，同年11月，沂南縣撤銷建制，雙堠公社劃歸蒙陰縣。
1961年8月沂南縣恢復，又劃回沂南。
1963年5月，雙堠公社改稱雙堠區(qū)，同時把縣界調整時劃歸蒙陰的營后、東河、梭莊三個鄉(xiāng)劃回雙堠區(qū)。
1968年8月，改稱雙堠公社。
1985年9月，區(qū)劃進行再次調整，撤銷原雙堠區(qū)，建立雙堠鄉(xiāng)，鄉(xiāng)駐地在雙堠。
1997年12月，經山東省民政廳批準，撤鄉(xiāng)設鎮(zhèn)。
2000年1月，全縣區(qū)劃調整后，與原南石門鄉(xiāng)合并，鎮(zhèn)駐地仍在雙堠，并沿用至今。