北宋時(shí)期設(shè)鎮(zhèn)治，石門鎮(zhèn)轄區(qū)原歸郯城縣。
1940年初，西部一度屬臨沭縣。
1942年，劃歸郯城縣。
東部屬江蘇省海陵縣（后改為東�？h）。
1953年9月，將東�？h第八區(qū)、第九區(qū)和郯城縣第九區(qū)各一部劃入，建立臨沭縣第十一區(qū)，設(shè)址石門。
1956年10月，劃歸郯城縣，時(shí)稱石門區(qū)。
1961年，復(fù)歸臨沭縣，稱石門公社。
1962年4月，改為石門區(qū)。
1969年3月，改為石門公社。
1970年11月，改為石門區(qū)。
1971年1月，改為石門人民公社。
1984年12月，撤公社，設(shè)石門鎮(zhèn)和前莊鄉(xiāng)。
1995年8月，撤前莊鄉(xiāng)，設(shè)前莊鎮(zhèn)。
2001年7月，石門鎮(zhèn)和前莊鎮(zhèn)合并為石門鎮(zhèn)。