秦朝時(shí)期，今西烏珠穆沁旗地區(qū)屬東胡。
西漢時(shí)期，屬烏桓。
東漢建和元年至延熹九年（147年—166年），屬鮮卑檀石槐所立首領(lǐng)庭統(tǒng)轄地。
三國和西晉時(shí)期，屬鮮卑轄區(qū)。
東晉和南北朝時(shí)期，基本處于地豆于、契丹、庫莫奚分治之間，或相互爭奪地區(qū)。
隋大業(yè)八年（612年），今旗境屬突厥牙帳統(tǒng)轄地區(qū)。
唐總章二年（669年），今旗境基本屬桑乾都督府，隸屬單于都護(hù)府。
開元二十九年（741年），基本屬東突厥牙帳統(tǒng)轄區(qū)。
元和十五年（820年），基本屬契丹統(tǒng)轄地。
五代十國時(shí)期，今旗境屬黑車子室韋。
遼朝時(shí)期，屬上京道臨潢府慶州管轄。
金朝時(shí)期，屬臨潢府路臨潢府慶州轄地。
元朝時(shí)期，今旗北部屬嶺北行省濟(jì)南王部（合赤溫后王封地），南部屬中書省全寧路和應(yīng)昌路轄地。
明正德五年（1510年），蒙古族首領(lǐng)巴圖孟克達(dá)延汗統(tǒng)一漠南蒙古諸部，今旗境屬左翼察哈爾萬戶地。
明末清初，成為烏珠穆沁部駐牧地。
清崇德六年（1641年），編烏珠穆沁右翼旗（俗稱西烏珠穆沁旗），封多爾濟(jì)為札薩克胡碩車臣親王，世襲掌理旗務(wù)，轄21佐領(lǐng)，隸屬錫林郭勒盟。
轄區(qū)包括今東烏珠穆沁旗中部及西烏珠穆沁旗中部及東部的大部分地區(qū)。
順治三年（1646年），編浩濟(jì)特左旗，轄境包括今西烏珠穆沁旗西部一部分地區(qū)。
民國三年（1914年），隨錫林郭勒盟劃歸察哈爾特別區(qū)。
民國十七年（1928年），改隸察哈爾省錫林郭勒盟。
民國二十六年（1937年），“七七”事變后，察哈爾省淪陷，屬偽蒙古聯(lián)盟自治政府（后改稱蒙疆聯(lián)合自治政府）管轄。
民國三十四年（1945年）8月，日本投降后，復(fù)歸察哈爾省管轄。
1949年，錫林郭勒盟東部聯(lián)合旗成立。
烏珠穆沁右翼旗、浩齊特左翼旗、烏珠穆沁左翼旗的17個(gè)佐合并改建成8個(gè)佐，由東部聯(lián)合旗民主政府統(tǒng)一管轄，政府駐烏蘭哈拉嘎廟，1951年遷至王蓋廟即今址。
1952年，撤銷第4佐，5佐改稱4佐，8佐改稱5佐，時(shí)東部聯(lián)合旗共轄7個(gè)佐。
1956年，經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)，東部聯(lián)合旗撤銷，分設(shè)西烏珠穆沁旗（轄1—4佐，后增設(shè)2佐）和東烏珠穆沁旗（轄5—7佐）。
同年10月，佐名依地名改稱蘇木。
1963年，內(nèi)蒙古自治區(qū)人民政府決定，將朝克烏拉人民公社和朝克烏拉公私合營牧場劃歸阿巴哈納爾旗。
1969年，北京軍區(qū)4618部隊(duì)接管杰仁、巴彥烏拉合營牧場，組建“五七”軍馬場（1971年退交地方）。
同年，北京軍區(qū)內(nèi)蒙古生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)五師組建，將國營高日罕牧場、哈日根臺人民公社、罕烏拉人民公社、白音華人民公社、寶日格斯臺合營牧場劃歸其5個(gè)團(tuán)。
1975年，兵團(tuán)撤銷，轄地移交錫林郭勒盟農(nóng)牧場管理局，之后陸續(xù)歸交地方。