今普蘭店區(qū)境在戰(zhàn)國時期屬燕國遼東郡。
西漢時期（公元前107年），定治于沓氏縣（在今鐵西辦事處）建立。
東漢時期（公元190年），該地區(qū)屬新置的平州遼東郡。
三國、西晉時期（公元238～274年），區(qū)境仍屬遼東郡。
[28]西晉末年（公元404年），區(qū)境被高句麗割據(jù)。
唐代（公元668年），區(qū)境為安東都護府所轄。
遼神冊四年（公元919年），置扶州、蘇州，區(qū)境分屬二州。
金末分屬復(fù)州、金州。
元代分屬金、復(fù)州萬戶府。
明代時，區(qū)境分屬金州衛(wèi)、復(fù)州衛(wèi)。
清代時，區(qū)境分屬復(fù)州、寧�？h（1843年后改為金州廳）。
1898年3月，沙俄強迫清政府簽訂《旅大租地條約》，同年5月簽訂《續(xù)訂旅大租地條約》占據(jù)旅大。
1899年8月，沙皇敕令實行“關(guān)東州”官制，設(shè)貔子窩（今皮口街道，下同）等4市5區(qū)。
1905年，俄日簽訂《樸茨茅斯和約》，沙俄將其旅大租借權(quán)轉(zhuǎn)讓給日本。
日軍占領(lǐng)金州，置金州軍政署，下設(shè)貔子窩、普蘭店、亮甲店等5個管區(qū)。
1908年，普蘭店管區(qū)改為出張所，隸屬金州民政支署。
民國八年（1919年），關(guān)東都督府改為關(guān)東廳。
民國十九年（1930年），金、普民政支署升格為民政署。
民國三十年（1931年），日本帝國主義發(fā)動“九·一八”事變，侵占了東北三省，將遼寧省改為奉天省，轄復(fù)縣（今瓦房店市）。
偽滿洲國成立，今市境北部屬偽滿洲國之復(fù)縣。
民國二十三年（1934年），設(shè)關(guān)東局，下設(shè)關(guān)東州廳，并實行會制，今區(qū)南部設(shè)貔子窩民政署、普蘭店民政署，下設(shè)38個會。
民國二十五年（1936年），偽滿洲國實行街村制，被復(fù)縣轄制的有復(fù)東、田家等16個村全部和復(fù)東鎮(zhèn)的大部、天臺村的小部分。
民國三十四年（1945年）9月初，中共膠東區(qū)委根據(jù)中央指示精神，決定將日偽統(tǒng)治時期設(shè)置的貔子窩、普蘭店民政署所轄38個會地域建置新金縣。
9月25日，中國共產(chǎn)黨領(lǐng)導(dǎo)下的新金縣政府在貔子窩宣告成立。
11月17日中共新金縣委成立。
1946年9月，新金縣三十里堡、亮甲店、登沙河3個區(qū)劃入金縣（今金州區(qū)，下同）；同年又從三十里堡區(qū)分劃出石河驛區(qū)，從登沙河區(qū)東北部劃出14個村成立杏樹屯區(qū)，亮甲店區(qū)北部13個村屯，增設(shè)華家屯區(qū)。
1947年2月5日，原隸屬于新金縣的長山區(qū)（現(xiàn)長�？h）劃入金縣。
1958年11月，經(jīng)中共遼寧省委、省政府批復(fù)，新金縣政府從貔子窩鎮(zhèn)遷到普蘭店鎮(zhèn)，縣直機關(guān)從15日起正式辦公。
1991年11月30日，經(jīng)國務(wù)院批準，撤銷新金縣，設(shè)立普蘭店市（縣級）。
1992年2月28日，普蘭店市成立大會召開。
2010年5月，大連市啟動新市區(qū)管理體制，將普蘭店市豐榮街道、南山街道、太平街道、鐵西街道劃入大連市新市區(qū)，與經(jīng)遼寧省政府批準金州區(qū)三十里堡街道、石河街道，瓦房店市炮臺鎮(zhèn)、復(fù)州灣鎮(zhèn)（后均改設(shè)街道）劃歸普蘭店市管轄成立的普蘭店灣新區(qū)（簡稱普灣新區(qū)），與普蘭店市政府合署辦公，同時掛普蘭店市政府和普灣新區(qū)管委會牌子，普蘭店市政府由府前路12號遷入炮臺鎮(zhèn)的普灣新區(qū)管委會。
2013年1月，經(jīng)遼寧省人民政府同意，普蘭店市元臺鎮(zhèn)、瓦窩鎮(zhèn)正式劃歸瓦房店市管轄。
2014年6月23日，國家級新區(qū)金普新區(qū)（位于大連市中南部，包括金州區(qū)全部行政區(qū)和普蘭店區(qū)部分地區(qū)總面積約2299平方公里）成立。
2015年10月13日，經(jīng)國務(wù)院批準，撤銷普蘭店市，設(shè)立普蘭店區(qū)。
2016年1月，為加快金州區(qū)城市建設(shè)，經(jīng)遼寧省人民政府同意將普蘭店區(qū)石河、三十里堡、炮臺、復(fù)州灣四個街道劃歸大連市金州區(qū)管轄。
2016年1月31日普蘭店區(qū)舉行成立大會，撤銷大連普灣新區(qū)黨工委、管委會，普灣新區(qū)黨工委、管委會不再與大連普蘭店區(qū)人民政府合署辦公，將普蘭店劃歸金州區(qū)的石河、三十里堡、炮臺、復(fù)州灣四個街道成立普灣經(jīng)濟區(qū)管委會在原普灣新區(qū)管委會辦公樓辦公承接原普灣新區(qū)管委會各大局，至此大連普灣經(jīng)濟區(qū)為大連市金州區(qū)四大正局級功能區(qū)之一，普蘭店區(qū)政府由金州區(qū)炮臺街道的普灣經(jīng)濟區(qū)管委會遷回府前路12號原普蘭店市人民政府大樓（后遷至普蘭店區(qū)世紀路西段98號）。
同時將原普蘭店市各大局、政府部門、行政機構(gòu)牌子正式更名大連普蘭店區(qū)。
2019年12月，經(jīng)大連市政府同意，太平街道和南山街道合并，撤銷南山街道，合并成立新的太平街道。