民國元年（1912年），北井子區(qū)隸屬鳳城縣第三區(qū)。
民國二十二年（1933年），北井子區(qū)隸屬安東縣。
民國三十四年（1945年）9月中旬，北井子為安東縣第七區(qū)。
民國三十六年（1947年）6月，成立安東縣北井子區(qū)工委和區(qū)公所。
1951年5月，與長山區(qū)合并。
1958年5月，撤區(qū)并鄉(xiāng)設(shè)北井子鄉(xiāng)；同年9月，把東尖山轄區(qū)內(nèi)的下崗、富家、山北3個(gè)村劃歸北井子，同時(shí)成立北井子公社。
1961年7月16日，長山、柞木、椅圈作業(yè)區(qū)從北井子公社劃出。
1961年7月4日，孤山鄉(xiāng)管轄的獐島劃歸北井子公社。
1983年8月8日，建立北井子鄉(xiāng)。
1985年3月5日，撤鄉(xiāng)建立北井子鎮(zhèn)。