清道光二十三年(1843年),金州廳在長(zhǎng)山列島設(shè)置小長(zhǎng)山島社。
清光緒二十年(1894年),中日甲午戰(zhàn)爭(zhēng)后,長(zhǎng)山列島被日本帝國(guó)主義侵占。
清光緒二十四年(1898年),帝俄占據(jù)旅大設(shè)置關(guān)東州廳,設(shè)長(zhǎng)山列島行政區(qū),下設(shè)小長(zhǎng)山島聯(lián)合村團(tuán)。
清光緒三十年(1904年),日本重新占領(lǐng)長(zhǎng)山列島。
清光緒三十二年(1906年),建小長(zhǎng)山島會(huì)。
民國(guó)三十四年(1945年)11月,建小長(zhǎng)山鄉(xiāng),屬長(zhǎng)山區(qū)。
1949年11月,建小長(zhǎng)山區(qū),屬長(zhǎng)山縣,時(shí)為縣黨政機(jī)關(guān)所在地(1960年遷駐大長(zhǎng)山島)。
1950年8月,改稱長(zhǎng)山縣第一區(qū)。
1955年6月,復(fù)稱小長(zhǎng)山區(qū)。
1956年3月,建小長(zhǎng)山、烏蟒2鄉(xiāng)。
1957年,增設(shè)鈀蛸鄉(xiāng)。
1958年6月,3鄉(xiāng)合并為小長(zhǎng)山鄉(xiāng)。
同年9月,撤鄉(xiāng)建立小長(zhǎng)山公社。
1983年10月,撤公社建小長(zhǎng)山鄉(xiāng)。
2017年,改小長(zhǎng)山島鎮(zhèn)。