芳溪鎮(zhèn)又名芳塘鎮(zhèn)，本地人叫芳溪鎮(zhèn)都叫芳塘鎮(zhèn)。
宋代方塘市即為全縣七個(gè)墟市之一，貿(mào)易長盛不衰，是縣境西部物資集散地。
清以前境內(nèi)大部分屬廣賢鄉(xiāng)，部分屬宣風(fēng)鄉(xiāng)。
芭蕉屬泰和鄉(xiāng)，石陂屬上高縣，花田、楊木、城溪、禾埠等村屬宣風(fēng)鄉(xiāng)。
1932年編組保甲，鎮(zhèn)境分屬第一、二、三、四區(qū)。
1935年鎮(zhèn)境分設(shè)4個(gè)保聯(lián)、16個(gè)保。
1939年4個(gè)保聯(lián)分別改名芳溪鄉(xiāng)、集興鄉(xiāng)、黃崗鄉(xiāng)、同興鄉(xiāng)。
1941年2月，芳溪鄉(xiāng)與集興鄉(xiāng)合并為芳溪鎮(zhèn)；同興鄉(xiāng)與祿集鄉(xiāng)合并為宣化鄉(xiāng)；蕉溪屬黃崗鄉(xiāng)，10月芳溪鎮(zhèn)改名芳溪鄉(xiāng)，翌年轄12保。
芭蕉屬雙庫鄉(xiāng)，禾埠、花田、城溪、楊木屬宣化鄉(xiāng)，蕉溪屬黃崗鄉(xiāng)。
1950年鎮(zhèn)境分屬城關(guān)區(qū)、芳溪區(qū)、宣鳳區(qū)，境內(nèi)設(shè)塘頭、香源、三村、南溪、炎嶺、芳溪、花田、城溪等鄉(xiāng)。
1952年增設(shè)簡家、蕉溪、禾埠（翌年撤銷）3鄉(xiāng)。
1956年芳溪、南溪、炎嶺、蕉溪4鄉(xiāng)合并為芳溪鄉(xiāng)；三村、香源2鄉(xiāng)合并為三村鄉(xiāng)；塘頭、簡家2鄉(xiāng)合并為花田鄉(xiāng)；城溪鄉(xiāng)并入浪源鄉(xiāng)。
1958年成立人民公社，又是黃崗山墾殖場的分場，同年又將花田鄉(xiāng)之原塘頭、簡家2小鄉(xiāng)并入芳溪鄉(xiāng)。
1959年城溪來屬。
1960年與黃崗山墾殖場脫鉤。
1968年全鄉(xiāng)合并為7個(gè)大隊(duì)26個(gè)生產(chǎn)隊(duì)，1969年禾埠、花田、楊木、石陂4個(gè)大隊(duì)由蓼市公社來屬。
1972年析出炎嶺大隊(duì)，全鄉(xiāng)分為蕉溪、香源、塘頭、刁櫪、城溪、禾埠、花田、楊木、石陂、南溪、芭蕉、廟前、上屋、下屋、新村、芳溪等大隊(duì)。
1983年公社復(fù)名鄉(xiāng)，下設(shè)村和村民小組。
1995年撤鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)。