秦始皇帝二十六年（前221)，設(shè)新淦縣，縣治淦陽鎮(zhèn)，隸屬九江郡，新始建國元年（9）新淦縣更名為偶亭縣，隸屬豫章郡。
東漢建武元年（25）偶亭縣復(fù)名新淦縣；永元八年（96）析新淦縣、廬陵縣地設(shè)石陽縣。
三國時(shí)末帝寶鼎二年（67）析新淦縣、石陽縣地設(shè)巴邱縣。
隋開皇十年（590）石陽、巴邱并入新淦縣，隸屬吉州。
南唐開元二年（938）新淦縣析崇學(xué)，高安縣建安、修高合設(shè)清江縣。
元貞元年（1295），新淦縣升為新淦洲。
明洪武二年（1369），新淦洲復(fù)名新淦縣；明嘉靖五年（1526），新淦縣析斷金、揚(yáng)名及善政、太平、上安國的部分地，共28部設(shè)置峽江縣。
1914年屬廬陵道；1931年屬南昌區(qū)；1932年屬第二行政區(qū)；1942年，屬第一行政區(qū)。
1949年6月20日，新淦縣人民政府成立，屬南昌區(qū)。
1952年4月屬吉安區(qū)。
1955年屬吉安專區(qū)。
1957年5月，新淦縣更名新干縣。
1968年2月份屬井岡山專區(qū)，1979年7月屬吉安地區(qū)，2000年8月屬地級(jí)吉安市。
沿用至今。