商、周以前屬揚(yáng)州；春秋時(shí)期屬吳地；戰(zhàn)國(guó)時(shí)屬楚地；秦時(shí)屬九江郡；東漢時(shí)屬?gòu)]陵郡。
漢獻(xiàn)帝建安四年（199）為遂興縣之一部分。
三國(guó)時(shí)吳大帝嘉禾四年（235）改稱新興縣。
西晉太康元年（280）復(fù)名遂興縣，其屬地并入泰和縣。
南唐寶大元年（943）設(shè)立了萬(wàn)安鎮(zhèn)。
據(jù)傳乃辟地得石符一帖，上有八分書云“地界兩州，神秀所幡，更為都邑，萬(wàn)民以安”，故名萬(wàn)安。
又因遂興江口時(shí)起五色祥云，故又別稱五云。
古有“五云呈祥，萬(wàn)民以安”之譽(yù)。
宋熙寧四年（1071）改萬(wàn)安鎮(zhèn)為萬(wàn)安縣。
元屬吉安路。
明清屬吉安府。
1914年屬?gòu)]陵道。
1926年直屬于省。
1932年屬第九行政區(qū)。
1935年屬第三行政區(qū)。
1949年8月，屬吉安地區(qū)專員公署管轄，1968年屬井岡山地區(qū)管轄。
1979年屬吉安地區(qū)行政公署管轄。
2000年8月，隸屬地級(jí)吉安市。
一直沿用至今。