南集鄉(xiāng)境在清代大部分隸屬大飛鎮(zhèn)，民國初屬大飛市，1929年屬第八區(qū)，1934年后屬第六區(qū)。
抗日民主政權建立后，1942年11月建南集區(qū)。
新中國成立后仍屬南集區(qū)，1956年2月撤銷南集區(qū)，改屬黃營區(qū)，1957年12月撤區(qū)并鄉(xiāng)時由守陽、道行及下營、范蕩、六堡、順集等鄉(xiāng)的一部分組成南集鄉(xiāng)，1958年8月成立南集人民公社，1983年6月，改稱南集鄉(xiāng)。
2000年初朱陳苗圃并入，改稱南集鎮(zhèn)。
10月全縣實施撤鄉(xiāng)并鎮(zhèn)，北集鄉(xiāng)并入南集鎮(zhèn)。