春秋戰(zhàn)國時期，先后屬吳、越、楚，因位于吳故都婁門之東，名婁邑。
秦置疁（liú）縣，屬會稽郡。
王莽始建國年間，更為婁治。
東漢時期稱婁縣。
以后歷經(jīng)漢、三國兩晉、南北朝的宋齊時，沿襲不變。
梁天臨六年（507），分婁縣置信義縣，屬信義郡。
梁大同二年（536），分信義縣置昆山縣。
隋開皇九年（589），撤昆山縣并入?yún)强h；十八年（598），復置昆山縣，屬蘇州。
唐天寶十年（751），析昆山南境、嘉興、海鹽的東北境置華亭縣，昆山縣治移至馬鞍山南今址。
宋嘉定十年（1217），析昆山東南境5鄉(xiāng)置嘉定縣。
元貞元年（1295），升昆山縣為昆山州，仍屬平江路。
明洪武二年（1369），降昆山州為縣，屬蘇州府。
明弘治十年（1497），析昆山、常熟、嘉定三縣部分地域置太倉州。
清雍正二年（1724），分昆山縣置新陽縣，兩縣同城分治，同屬蘇州府。
1912年，昆山、新陽兩縣合并，名昆山縣，屬江蘇省上海道。
1914年，屬蘇常道。
1934年，屬無錫行政督察區(qū)。
1949年5月，屬蘇州專署；7月，建立昆山縣人民政府。
1968年3月，屬蘇州專區(qū)。
1971年4月，屬蘇州地區(qū)。
1983年3月，屬蘇州市。
1989年9月，昆山撤縣設市。