宋始境南屬來春鄉(xiāng)，北屬良信鄉(xiāng)，清南屬觀山鄉(xiāng)，北屬景賢鄉(xiāng)，1946年屬景賢鄉(xiāng)。
1955年為景賢鄉(xiāng)第8、2初級社，1957年為申港鄉(xiāng)第17、16高級社，1958年為申港公社第6工區(qū)，1959年為申港公社15、14大隊。
1982年為申港公社何巷里大隊和牌樓下大隊。
1984年為申港鄉(xiāng)牌樓下村村民委員會和何巷里村村民委員會。
2003年8月兩村合并為申港鎮(zhèn)申南村村民委員會。
2008年為申港街道申南村村民委員會，2013年區(qū)劃調整后為臨港街道申南村村民委員會。
2017年10月臨港街道撤銷，恢復成申港街道申南村村民委員會。