明至清初，屬揚州府泰州何垛鹽場。
清乾隆三十三年（1768年），屬揚州府東臺縣何垛場。
1913年11月，屬東臺縣何垛市。
1940年10月，分屬東臺縣潘丿區(qū)和海豐區(qū)。
1945年8月，屬東臺縣曹丿區(qū)。
1948年7月，屬東臺縣六灶區(qū)。
1949年10月，屬曹丿區(qū)管轄。
1958年9月，劃屬東臺縣四灶人民公社。
1959年2月，建立頭灶人民公社。
1983年9月，政社分設(shè)，建立頭灶鄉(xiāng)。
1987年7月，撤銷頭灶鄉(xiāng)，以其原轄區(qū)域設(shè)立頭灶鎮(zhèn)，屬東臺縣。
2001年7月，撤銷頭灶鎮(zhèn)、六灶鎮(zhèn)，將原頭灶鎮(zhèn)、六灶鎮(zhèn)所轄區(qū)域合并設(shè)立新的頭灶鎮(zhèn)。
2010年4月，撤銷頭灶鎮(zhèn)、曹丿鎮(zhèn)，將原頭灶鎮(zhèn)、曹丿鎮(zhèn)所轄區(qū)域合并設(shè)立新的頭灶鎮(zhèn)。