1949年—1956年，該區(qū)域?qū)倜裰鬣l(xiāng)。
1956年—1957年，屬五里墩街道。
1957年—1960年，隨著五里墩街道合并至車站街道，屬車站街道。
1960年—1961年，屬漢陽人民公社車站分社。
后撤銷分社，1961年—1980年，屬車站街道（于1973年改名翠微街道），1980年，翠微街道一分為二，重屬五里墩街道。
2000年，原五里新村居民委員會、五里二村居民委員會、張家上灣居民委員會北側(cè)部分合并成為五琴里社區(qū)居民委員會。
五里三村雖地處該轄區(qū)，但為五墨里社區(qū)冷凍機廠宿舍樓，原歸屬于五墨里社區(qū)居民委員會管轄，2005年劃入五琴里社區(qū)居民委員會。
2012年，由原五里一村居民委員會與五里后村居民委員會合并成立的五新里社區(qū)居民委員會又因武漢軌道交通四號線的建設拆遷并入五琴里社區(qū)居民委員會。