原屬考城。
清乾隆四十八年（1783）劃歸睢州。
1912年屬睢縣。
1928年劃歸民權(quán)縣，屬孫六區(qū)吳屯聯(lián)保。
1948年屬孫六區(qū)，在此設(shè)吳屯鄉(xiāng)。
1956年屬王莊寨鄉(xiāng)，稱吳屯高級(jí)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)合作社。
1958年屬孫六人民公社，稱吳屯生產(chǎn)大隊(duì)。
1961年屬孫六區(qū)。
1963年屬林七區(qū)。
1965年屬孫六公社。
1969年屬王莊寨公社，稱吳屯生產(chǎn)大隊(duì)。
1983年屬王莊寨鄉(xiāng)，稱吳屯村民委員會(huì)。
2009年屬王莊寨鎮(zhèn)，稱吳屯村民委員會(huì)至今。