今樺川一帶，清屬三姓副都統(tǒng)管轄。
清光緒三十二年（1906），分屬依蘭府和臨江州。
清宣統(tǒng)元年（1909），于依蘭府南境之“樺皮川”，設(shè)置樺川縣，縣治設(shè)于東興鎮(zhèn)（今佳木斯）。
隸屬吉林省東北路道。
清宣統(tǒng)二年(1910)，時(shí)逢東興鎮(zhèn)水災(zāi)，省民政司批準(zhǔn)移治悅來鎮(zhèn)。
1914年改隸依蘭道。
1929年由吉林省直轄。
1934年劃歸偽三江省管轄。
同年，縣公署遷至佳木斯鎮(zhèn)。
1945年隸屬合江省。
1946年將樺川縣南部的永豐鎮(zhèn)、千振街等地劃出，設(shè)置樺南縣。
1949年屬松江省。
1954年屬合江專區(qū)。
1956年撤銷樺南縣并于樺川縣，縣駐地設(shè)在湖南營鎮(zhèn)。
1964年恢復(fù)樺南縣，樺川縣政府遷回悅來鎮(zhèn)。
1985年劃歸佳木斯市管轄。
樺川縣名稱沿用至今。