明代時期，黑土鎮(zhèn)境域?qū)俣淠銊t溪。
清代時期，屬太平里八甲。
民國初期，屬南區(qū)。
民國三十三年（1932年），設黑土鎮(zhèn)，屬六區(qū)。
民國二十四年（1935年），屬四區(qū)蒙梭聯(lián)保八保。
民國三十三年（1944年），屬嶺南鄉(xiāng)。
1950年1月，屬五區(qū)；同年6月，屬八區(qū)。
1952年2月，設鄉(xiāng)，屬十二區(qū)。
1958年9月，成立設公社。
1959年1月，改為管理區(qū)。
1961年8月，恢復為公社。
1967年12月，成立革命委員會。
1992年1月，為黑土鄉(xiāng)。
2016年，撤銷黑土鄉(xiāng)，設置黑土鎮(zhèn)。