民國時期，屬濟同鄉(xiāng)。
1950年，屬青杠坡區(qū)。
1953年，屬楊家坳鄉(xiāng)、水口鄉(xiāng)。
1958年公社時代，取名城頭蓋大隊，屬青杠坡公社管轄。
1961年，撤銷以區(qū)為公社的建制，將管理區(qū)改為公社。
1963年，城頭蓋大隊屬青杠坡區(qū)的楊家坳公社管轄。
1984年社改鄉(xiāng)，建立楊家坳鄉(xiāng)、大盆水鄉(xiāng)、水口寺鄉(xiāng)，城頭蓋村屬青杠坡區(qū)的楊家坳鄉(xiāng)管轄。
1992年2月，貴州省人民政府批準思南縣進行“建鎮(zhèn)并鄉(xiāng)撤區(qū)”工作，同年10月，將原楊家坳鄉(xiāng)、大盆水鄉(xiāng)、水口寺鄉(xiāng)合并為楊家坳苗族土家族鄉(xiāng)，轄原三個鄉(xiāng)鎮(zhèn)的共19個行政村，城頭蓋村屬楊家坳苗族土家族鄉(xiāng)管轄。
2007年4月，縣人民政府下達《關(guān)于撤小村并大村整合的批復》，全縣開展撤小村并大村工作，把全縣561個村合并成168個村，楊家坳苗族土家族鄉(xiāng)將原34個村合并為9個村，其中，邵家渡村、關(guān)田壩村、堰塘村、城頭蓋村合并為城頭蓋村。
2010年11月16日，思南縣人民政府批準調(diào)整全縣行政區(qū)劃，楊家坳苗族土家族鄉(xiāng)調(diào)整設置為32個行政村，1個社區(qū)，城頭蓋村屬楊家坳苗族土家族鄉(xiāng)管轄。