1958年公社時代，取名三匯溪大隊。
1982年10月31日，全縣行政區(qū)劃調(diào)整，三匯溪大隊屬許家壩區(qū)三溪公社管轄。
1984年調(diào)整為村。
1985年全縣行政區(qū)劃再次調(diào)整，三匯溪村屬許家壩區(qū)三溪鄉(xiāng)管轄。
1992年2月，貴州省人民政府批準(zhǔn)思南縣進(jìn)行“建鎮(zhèn)并鄉(xiāng)撤區(qū)”工作，建立許家壩鎮(zhèn)，三匯溪村屬許家壩鎮(zhèn)管轄。
2007年4月，縣人民政府下達(dá)《關(guān)于撤小村并大村整合的批復(fù)》，將三匯溪村更名為三匯村同時并入馬畔塘村，屬許家壩鎮(zhèn)管轄。
2010年11月16日，思南縣人民政府批準(zhǔn)調(diào)整全縣行政區(qū)劃，恢復(fù)三匯村，屬許家壩鎮(zhèn)管轄。