據(jù)《寶安縣志》（1997年版）記載，南灣街道所轄地域歷史上曾先后隸屬南交（夏、商、周）、南�？しh（秦）、博羅縣（漢、三國）。
晉咸和六年（332年）、唐至德二年（757年），屬寶安縣。
唐至德二年（757年）、明萬歷元年（1573年），屬東莞縣。
明萬歷元年（1573年），屬新安縣。
清康熙五年（1666年）至清康熙八年（1669年），屬東莞縣。
清康熙八年（1669年）至民國三年（1914年），屬新安縣。
民國三年（1914年）至1979年1月，屬寶安縣。
1949年10月，布吉鄉(xiāng)隸屬寶安縣。
翌年4月，寶安縣整編為4個區(qū)，布吉鄉(xiāng)隸屬第三區(qū)。
1952年10月，擴大區(qū)級建制，布吉鄉(xiāng)改屬第二區(qū)。
1953年7月，調(diào)整區(qū)劃，布吉鄉(xiāng)改屬第八區(qū)。
1955年秋，第八區(qū)更名布吉區(qū)，布吉鄉(xiāng)屬之。
1958年3月，撤區(qū)并鄉(xiāng)，布吉鄉(xiāng)由寶安縣直接管轄。
同年10月，撤銷布吉鄉(xiāng)和平湖鄉(xiāng)，設(shè)立紅旗公社。
翌年1月，紅旗公社改稱布吉公社。
1979年1月至1981年10月，屬深圳市。
1981年10月至1992年12月，屬寶安縣。
1983年7月，布吉公社改為布吉區(qū)。
1986年8月，布吉改區(qū)為鎮(zhèn)。
1993年1月，寶安撤縣分設(shè)寶安、龍崗二區(qū)，布吉鎮(zhèn)屬龍崗區(qū)。
2004年，寶安、龍崗兩區(qū)撤鎮(zhèn)設(shè)街，布吉街道辦仍屬龍崗區(qū)管轄。
2006年4月，布吉街道“一分為三”，南灣街道成立。