據(jù)傳該地在宋朝已被起名儒村，后改名紅旗村；宋朝高宗皇帝趙禎，帝號(hào)“皇佑”，于皇佑六年（公元1049）經(jīng)過(guò)本村，于是村民將村名改稱皇佑村；到1921年屬石磜鄉(xiāng)稱皇佑村；1950年稱皇佑村屬北磜鄉(xiāng)；1952年稱皇佑鄉(xiāng)；1959年屬梅東公社稱皇佑生產(chǎn)大隊(duì)，1960年梅東公社改稱松源公社，1961年屬北磜公社；1983年屬北磜區(qū)稱皇佑鄉(xiāng)，1987年屬北磜鄉(xiāng)稱皇佑村委會(huì)；1990年改為皇佑管理區(qū)；1999年至今稱為皇佑村民委員會(huì)；2004年撤北磜鎮(zhèn)并入南磜鎮(zhèn)。