南宋時，屬古海鄉(xiāng)。
明、清代稱黃旗都。
民國元年（1912年）后，稱第九區(qū)。
1949年11月，成立中山縣第九區(qū)人民政府，駐大黃圃。
1950年4月，中山縣第九區(qū)分出三角、浪網(wǎng)、民眾組建第十區(qū)。
1953年3月，分設黃圃鎮(zhèn)，成為中山縣3個區(qū)級鎮(zhèn)之一。
1957年2月，從大黃圃分出南頭鄉(xiāng)。
1958年10月，小黃圃和高黎從大黃圃分出劃歸順德縣。
1966年8月，從黃圃公社分出阜沙鄉(xiāng)，成立阜沙公社。
1986年11月，撤區(qū)并鎮(zhèn)，原黃圃鎮(zhèn)與黃圃區(qū)合并為黃圃鎮(zhèn)。