姚姓人氏最早在此立村，寧遠(yuǎn)村有一個(gè)寧遠(yuǎn)墟，因?yàn)檫@個(gè)市場很興旺，當(dāng)時(shí)吸引了東莞市商人那邊過來到寧遠(yuǎn)墟做生意，漸漸地從東莞市過來定居的商人越來越多，后來寧遠(yuǎn)村就改名為東莞村。
清康熙17年名為寧遠(yuǎn)村。
清代中葉，屬獅嶺巡檢司李溪四十三圖城西南五十里，民國初年，全縣廢縣改區(qū)，屬三區(qū)東鏡鄉(xiāng)。
民國27年（1938年）花縣6個(gè)區(qū)并為兩個(gè)區(qū)，屬第一區(qū)東境鄉(xiāng)。
民國29年（1940年）花縣2個(gè)區(qū)分為3個(gè)區(qū)，屬獅龍區(qū)東境鄉(xiāng)。
民國31年花縣整編為3個(gè)行政區(qū)，屬第三行政區(qū)。
民國35年（1946年）花縣撤銷3個(gè)行政區(qū)，改為縣政府直轄24鄉(xiāng)，屬橫潭鄉(xiāng)東莞村。
1949年10月全縣分東中西三個(gè)區(qū)，屬中區(qū)橫潭鄉(xiāng)東莞村。
1950年4月全區(qū)分5個(gè)區(qū)，屬第三區(qū)橫潭鄉(xiāng)東莞村，將東莊，黑坭莊劃分至石塘村。
1958年為西莊、北莊兩高級(jí)農(nóng)業(yè)生產(chǎn)合作社。
改為村頭、村委兩大隊(duì)。
1963年合為一個(gè)大隊(duì)，為東莞大隊(duì)。
1983年為東莞鄉(xiāng)。
1987年1月，隸屬新華區(qū)公所。
1987年3月，隸屬新華鎮(zhèn)人民政府。
2013年12月，依據(jù)粵民區(qū)[2013]18號(hào)文件，東莞村歸由新雅街道管轄，并沿用至今。