據(jù)《陳氏宗親族譜》記載，陳忠之三子陳昂于宋徽宗十五年從廣東東莞七都遷來此地定居建村。
1951年從原水貝村分出命名為上村，屬寶安縣四區(qū)（上南區(qū)）管理。
1952年10月，寶安縣劃分7區(qū)71鄉(xiāng)，上村屬第七區(qū)水蓢鄉(xiāng)管轄。
1963年2月，公明公社合并大隊，上村屬公明公社上村大隊。
1993年1月，原深圳市寶安縣公明鎮(zhèn)上村改為深圳市寶安區(qū)公明鎮(zhèn)上村。
2004年7月，因城市化改制，改上村村委會為上村社區(qū)居委會，名稱沿用至今，隸屬公明街道。