民國十八年（1929年），屬玉門縣第區(qū)。
民國三十二年（1943年），屬靖邊鄉(xiāng)。
民國三十八年（1949年），設(shè)靖邊區(qū)，轄10鄉(xiāng)。
1953年，將靖邊區(qū)分設(shè)靖西、靖東2區(qū)，靖西區(qū)轄川北鎮(zhèn)、南陽鎮(zhèn)、芨芨臺子、黃閘灣、西黃花營、東黃花營6鄉(xiāng)。
1955年，撤區(qū)并鄉(xiāng)，設(shè)南陽鎮(zhèn)、黃閘灣（包括西黃花營）黃花營3鄉(xiāng)。
1958年，成立衛(wèi)星公社，后屬玉門鎮(zhèn)公社靖西管理區(qū)。
1961年5月，設(shè)立黃閘灣公社增設(shè)北湖村。
1983年3月，改為黃閘灣鄉(xiāng)。
2016年1月，根據(jù)《甘肅省民政廳關(guān)于酒泉市肅州區(qū)泉湖鄉(xiāng)等8個鄉(xiāng)鎮(zhèn)撤鄉(xiāng)改鎮(zhèn)的批復(fù)》（甘民復(fù)〔2015〕50號），黃閘灣鄉(xiāng)撤鄉(xiāng)改鎮(zhèn)，改為黃閘灣鎮(zhèn)。
2016年5月，正式撤鄉(xiāng)改鎮(zhèn)掛牌。