西漢時(shí)，置天陵縣。
西晉時(shí)，設(shè)有新鄉(xiāng)縣，均治昌馬。
北周時(shí)，并會(huì)稽、延興、新鄉(xiāng)為會(huì)稽縣。
隋時(shí)，改會(huì)稽縣為玉門縣。
唐時(shí)，為樊梨花割據(jù)，西有寒江關(guān)，關(guān)在石包城。
此后雖有變更，但均沿屬玉門。
1949年以前，為玉門縣昌馬鄉(xiāng)。
1949年，設(shè)玉門縣昌馬區(qū)。
1953年，又分上窖為上窖、戈壁2鄉(xiāng)。
1955年，撤區(qū)并鄉(xiāng)，設(shè)上窖、下窖、西河3鄉(xiāng)。
1956年，下窖鄉(xiāng)并入西河鄉(xiāng)。
1958年9月，成立東風(fēng)公社；同年11月，東風(fēng)公社改為昌馬公社。
1983年3月，昌馬公社改鄉(xiāng)。
2005年，昌馬鄉(xiāng)并入赤金鎮(zhèn)。
2010年6月7日，恢復(fù)昌馬鄉(xiāng)。
2018年，昌馬鄉(xiāng)撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)。