明代，屬寧遠(yuǎn)縣在城里。
清代，屬寧遠(yuǎn)縣十甲里。
民國元年（1912年）后，屬武山縣山丹鎮(zhèn)。
1949年8月，武山解放后，屬縣城區(qū)，設(shè)山丹、韓川、清池、水峪1鎮(zhèn)3鄉(xiāng)。
1953年10月，屬縣城區(qū)，設(shè)賈河、山丹、清池1鎮(zhèn)2鄉(xiāng)。
1955年11月，3鄉(xiāng)（鎮(zhèn)）并為山丹鎮(zhèn)。
1958年9月，并入超英公社，設(shè)水峪、山丹2管理區(qū)。
1962年1月，改為山丹公社、水峪公社。
1965年8月，撤區(qū)并社，水峪公社并入山丹公社。
1983年12月，改為山丹鄉(xiāng)。
2015年，撤鄉(xiāng)設(shè)鎮(zhèn)。