1949年10月，玄馬隸屬于新堡區(qū)玄馬灣鄉(xiāng)玄馬村。
1955年11月，新堡區(qū)撤銷(xiāo)，房里鄉(xiāng)并入玄馬灣鄉(xiāng)，玄馬隸屬于玄馬灣鄉(xiāng)玄馬村。
1958年4月，玄馬隨玄馬灣鄉(xiāng)玄馬村并入樊家廟鄉(xiāng)。
1958年9月，將樊家廟、肖原、城關(guān)三個(gè)鄉(xiāng)合建為慶豐公社，玄馬村改稱(chēng)玄馬大隊(duì)，玄馬改稱(chēng)玄馬生產(chǎn)隊(duì)，隸屬于慶豐公社。
1961年5月，增設(shè)玄馬公社，玄馬生產(chǎn)隊(duì)隨玄馬大隊(duì)劃歸玄馬公社。
1962年2月，增設(shè)賈橋公社。
1965年2月，賈橋、玄馬兩公社合并為玄馬公社，玄馬大隊(duì)玄馬生產(chǎn)隊(duì)隸屬于玄馬公社。
1983年12月，玄馬公社改為為玄馬鄉(xiāng)人民政府，玄馬大隊(duì)改稱(chēng)玄馬村民委員會(huì)，玄馬生產(chǎn)隊(duì)改稱(chēng)玄馬村民小組。
2003年1月，撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，改稱(chēng)玄馬鎮(zhèn)人民政府玄馬村民委員會(huì)。