民國初期，沿襲清制，武威縣的行政管理區(qū)按水系劃分為六個(gè)渠，即黃渠（黃羊河水系）、大渠（雜木河上游）、雜渠（雜木河下游）、金渠（金塔河水系）、懷渠（西營河上游）、永渠（西營河下游）。
民國24年（1935），將六個(gè)行政管理區(qū)劃分為2個(gè)鎮(zhèn)、12個(gè)鄉(xiāng)，屬雙城鄉(xiāng)果園溝保。
中華人民共和國成立初期屬雙城區(qū)九鄉(xiāng)，為第三行政村。
1953年屬果園鄉(xiāng)，為第三行政村。
1956年撤區(qū)并鄉(xiāng)后屬洪祥鄉(xiāng)第三高級社。
1958年人民公社化后屬雙城公社，命名為果園大隊(duì)。
1962年區(qū)劃調(diào)整后屬永昌區(qū)洪祥公社，更名為果園大隊(duì)。
1983年社改鄉(xiāng)時(shí)設(shè)果園村民委員會(huì)，屬洪祥鄉(xiāng)管轄。
2002年9月，洪祥鄉(xiāng)撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)，果園溝村民委員會(huì)屬洪祥鎮(zhèn)管轄。