前身為秦家灣村和李家墩村。
1955年建秦家灣初級社；1957年轉(zhuǎn)為橋墩高級社；1958年為敦煌人民公社黨河大隊橋墩生產(chǎn)隊；1961年為黨河人民公社秦家灣大隊；1966年更名為紅山大隊；1969年恢復(fù)為秦家灣大隊；1983年3月撤大隊設(shè)村；2007年合村并組，原李家墩村并入秦家灣村，秦家灣村村名仍然沿用。
李家墩村土改時屬三區(qū)三鄉(xiāng)三行政；1955年建李家墩、達(dá)家灣兩個初級社；1957年并建為橋墩高級社；1958年為敦煌人民公社黨河大隊橋墩生產(chǎn)隊；1961年更名為黨河人民公社李家墩大隊；1966年更名為上游大隊；1969年恢復(fù)為李家墩大隊；1983年3月撤大隊設(shè)村；2007年撤村并入秦家灣村，現(xiàn)已消失。