唐初屬武榮州南安縣。
開元六年（718年）屬泉州晉江縣東鄉(xiāng)。
宋太平興國六年（981年）分屬惠安縣城山鄉(xiāng)崇德、德音、光德、待賢里，崇善鄉(xiāng)歸化里。
元、明分屬信義鄉(xiāng)歸化里四都，行滿鄉(xiāng)崇德里五都，忠恕鄉(xiāng)德音里六都、七都、八都，光德里九都、十都，待賢里十一都，長安里二十都。
清分屬四都驛坂鋪，五都福山鋪，六都鰲塘鋪、承天鋪，七都安埕鋪、鼓樓鋪，八都后林鋪、蔡林鋪，九都竹溪鋪，十都東林鋪、仙塘鋪、添奇鋪，十一都樟市鋪、良興鋪、添奇鋪，二十都梅峰鋪。
民國初，仍沿清制。
1928年分屬涂嶺、山腰、壩頭三區(qū)；1934年，分屬涂嶺、壩頭兩區(qū)；1935年屬第五自治區(qū)，1936年屬第三區(qū)（區(qū)署設(shè)壩頭）；1941年，仍屬第三區(qū)（區(qū)公所改駐涂嶺）；1943年，今域分屬山腰鄉(xiāng)、壩頭鄉(xiāng)、奎峰鄉(xiāng)、涂嶺鄉(xiāng)、梅峰鄉(xiāng)、天馬鄉(xiāng)；1947年分屬錦鳳鄉(xiāng)、圭峰鄉(xiāng)、梅東鄉(xiāng)、天馬鄉(xiāng)、涂嶺鄉(xiāng)。
中華人民共和國成立后，1949年9月今域分屬壩頭、涂嶺兩區(qū)。
1951年，壩頭區(qū)改稱山腰區(qū)，增設(shè)南埔區(qū)，今域分屬山腰、南埔、涂嶺三區(qū)。
1958年分屬壩頭鄉(xiāng)、山腰鄉(xiāng)、南埔鄉(xiāng)、玉湖鄉(xiāng)、峰尾鄉(xiāng)、土坑鄉(xiāng)、涂嶺鄉(xiāng)、驛坂鄉(xiāng)、東寨鄉(xiāng)等九鄉(xiāng)。
隨后人民公社化，今域?qū)俪裙纭?/p>
1961年分為山腰公社、后龍公社、南埔公社、涂嶺公社。
1984年10月，人民公社改為鄉(xiāng)（鎮(zhèn)），今域分屬山腰、后龍、南埔、涂嶺四鄉(xiāng)。
1985年4月11日，省政府批準設(shè)立肖厝鎮(zhèn)，以南埔、后龍、山腰3個鄉(xiāng)及涂嶺鄉(xiāng)部分行政區(qū)域為肖厝鎮(zhèn)的行政區(qū)域，下轄86個村委會。
1991年7月14日，泉州市人民政府根據(jù)福建省人民政府閩政[1985]綜183號文精神，設(shè)立肖厝鎮(zhèn)，并于1992年9月29日成立鎮(zhèn)人民政府。
1996年3月1日，省民政廳批準撤銷肖厝鎮(zhèn)，設(shè)立后龍、山腰、南埔、涂嶺、埭港5個鎮(zhèn)。
1996年4月21日，福建省人民政府批準成立泉州市肖厝經(jīng)濟開發(fā)管理委員會（簡稱肖厝管委會），為泉州市人民政府派出的正縣級行政機構(gòu)，統(tǒng)一管理協(xié)調(diào)區(qū)域內(nèi)經(jīng)濟建設(shè)和社會發(fā)展事務(wù)，下轄南埔、后龍、山腰、涂嶺、埭港5個鎮(zhèn)和國有山腰鹽場。
1996年7月11日，肖厝管委會正式掛牌辦公。
1999年8月經(jīng)福建省民政廳批準，鎮(zhèn)級行政區(qū)劃調(diào)整為南埔、界山、后龍、峰尾、山腰、前黃、涂嶺等7個鎮(zhèn)和國有山腰鹽場。
2000年4月12日，國務(wù)院批準：同意設(shè)立泉州市泉港區(qū)。
泉港區(qū)轄原惠安縣的山腰鎮(zhèn)、后龍鎮(zhèn)、南埔鎮(zhèn)、涂嶺鎮(zhèn)、埭港鎮(zhèn)5個鎮(zhèn)。
同年12月28日，泉港區(qū)正式掛牌成立。