據(jù)考證：早在新石器時代，峰尾區(qū)域劃歸為“七閩地”，春秋戰(zhàn)國時期歸屬越地。
在秦時為“閩中群”，在東漢時為會稽（今浙江紹興），在隋時為閩州（今福州），在唐時為武州（今南安），至宋太平興國六年（981年）拆劃晉江東北16個里置惠安縣，領轄三鄉(xiāng)。
峰尾屬惠安縣東北城山鄉(xiāng)。
慶歷八年（1048年）惠安縣為18個里，當時的“城山鄉(xiāng)”（原惠北）領轄崇德、德音、光德、待賢、民蘇5個里，峰尾屬“德音里”。
元貞元年（1295）年惠安縣改為“文質”、“行滿”、“忠恕”、“信義”四個鄉(xiāng)，分18里、34都。
明初至正統(tǒng)年間（1436—1449年），峰尾仍屬“德音里八都”。
清康熙二十年（1681年）改為68鋪，峰尾屬“八都厚林鋪”。
清初沿舊制，民國初年行政區(qū)域仍沿用清制。
1928年設12區(qū)，區(qū)公所駐地為涂嶺、山腰、壩頭。
至1936年5月，惠安縣縮編為4個區(qū)署，峰尾屬三區(qū)，由壩頭連保。
1941年分二個區(qū)公所，區(qū)公所設在涂嶺，峰尾屬三區(qū)涂嶺“梅峰鄉(xiāng)”。
1943年撤區(qū)公所設16個鄉(xiāng)鎮(zhèn)，峰尾為“圭峰鄉(xiāng)”，駐地峰尾。
1947年圭峰鄉(xiāng)公所轄“誠中、誠實、誠樸、華音、崢嶸、奎壁、荷池、荻州、蓮山”9個保戶，134甲計3340戶數(shù)。
鄉(xiāng)鎮(zhèn)所在地“峰尾街”，面積18.2平方千米。
1949年9月5日，惠安縣人民政府宣布成立，峰尾仍屬惠安縣管轄。
1955年5月，惠安縣分為12個區(qū)，峰尾屬第十二區(qū)，區(qū)長為何玉衡。
1958年10月，撤銷區(qū)、鄉(xiāng)政府，成立人民公社，峰尾屬“超先公社”。
1961年10月，惠安縣改劃為15個人民公社、1個國營鹽場。
至1979年，原惠北地區(qū)有山腰、后龍、南埔、涂嶺4個公社個1個山腰鹽場。
峰尾屬后龍公社，后龍公社管轄上西、峰前、群團、土坑、田里、刈山、和平、和星、郭厝、誠峰、誠平、前亭、土樓、崢嶸、奎壁等16個大隊計256個生產隊。
1984年10月1日起實行政社分開，原“人民公社”改為鄉(xiāng)（鎮(zhèn)），“大隊”改為“村委會”、“生產隊”改為“村民小組”。
1986年惠安縣改為11個鄉(xiāng)、4個鎮(zhèn)，現(xiàn)泉港區(qū)為當時“肖厝鎮(zhèn)”，轄4個辦事處，峰尾屬后龍辦事處。
1996年4月，肖厝鎮(zhèn)升格為“肖厝經濟開發(fā)區(qū)管委會”，享受省級開發(fā)區(qū)待遇。
2000年8月，原后龍鎮(zhèn)分設后龍、峰尾兩個鎮(zhèn)。
同年4月，原肖厝管委會經國務院批準設立泉港區(qū)。
同年12月掛牌成立泉港區(qū)人民政府，峰尾鎮(zhèn)屬之。