民國時期屬林森縣白湖區(qū)管轄，解放后屬閩侯專署閩侯縣管轄。
稱閩侯第一區(qū)（又稱閩侯縣城門區(qū)），1970年2月撤銷城門區(qū)成立城門公社（文革期間稱東方紅公社），1976年改稱城門公社革命委員會，1984年9月改名城門鄉(xiāng)，1992年10月撤銷城門鄉(xiāng)建制改稱城門鎮(zhèn)至今。
城門鎮(zhèn)于1972年因福州市區(qū)劃調(diào)整脫離閩侯縣歸朝陽區(qū)（今倉山區(qū)）管轄，1990-2005年劃歸福州市郊區(qū)管轄，1996年1月1日因福州市區(qū)劃再次調(diào)整，重歸倉山區(qū)至今。