1949年前屬大河鄉(xiāng)第八保的一部分。
1951年民主建政時(shí)為第八村的一部分，屬大河鄉(xiāng)。
1953年3月，由大河析置木楠鄉(xiāng)時(shí)，第八村隨劃，并分置為兩個(gè)村，清水村即以境內(nèi)清水溪命名。
1956年1月，木楠廢入小河鄉(xiāng)，清水村隨隸。
1958年時(shí)，改稱清水管區(qū)，屬小河區(qū)隊(duì)，1961年又改稱清水大隊(duì)。
屬小河公社。
1981年地名普查時(shí)，更小河名水寒，復(fù)又更名為木楠公社，大隊(duì)仍屬，1984年1月，清水大隊(duì)改稱清水村，同時(shí)設(shè)立清水村村民委員會(huì)，隸木楠鄉(xiāng)。
2001年，新建保家鎮(zhèn)，木楠鄉(xiāng)隸屬，村隨屬。
2003年12月組建清水村，含原過路村、清水村、木洞村，名稱沿用至今。